مطابق بررسی «دقیق» شهردار جدید پایتخت، «بدهی» سنگین حداقل 30 هزار میلیارد تومانی، «تعهد» مالی 22 هزار و 500 میلیارد تومانی به پیمانکاران پروژه‌های فعال و «کسری» 28 درصدی بودجه شهر، سه چالش بزرگ شهرداری در این دوره محسوب می‌شود که امکان اداره تهران را بسیار سخت کرده است

معاونت نظارت شورای شهر تهران با اشاره به ابلاغ بخشنامه ممنوعیت صدور هولوگرام اعتباری از سوی شهردار تهران گفت: هولوگرام‌ و پیچیدگی‌ عملکردی که به واسطه آن در شهرداری ایجاد شده بود، ابهامات بسیار زیادی را در این خصوص به وجود آورده بود، به‌طوری که صدور هولوگرام زیان‌های بسیاری به شهرداری تحمیل کرد

تصفیه بدهی شهرداری تهران از کانال «توزیع برگه‌های پیش‌فروش تراکم ساختمانی» موسوم به «هولوگرام اعتباری»، با دستور کتبی شهردار متوقف شد.

محمدعلی نجفی با انتخاب چهار معاون خود، گفت: مدیران و کارکنان شهرداری تهران بهشتی‌اند؛ اما مسئله جابه‌جایی مدیران امری طبیعی است. وقتی مدیر اصلی یک دستگاه تغییر می‌کند، متناسب با برنامه‌های جدید، تغییراتی در مدیران ایجاد می‌کند

فاز اول انتشار عمومی اطلاعات شهری باارزش، «افشای کاربری‌» املاک موجود در تهران عنوان شده است که برای تحقق آن باید امکان «دسترسی نامحدود» همه شهروندان به داده‌های سامانه استعلام طرح تفصیلی فراهم شود